Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Serpina1cQ00896 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Serpina1cQ00896 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Serpina1cQ00896 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Serpina1cQ00896 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Serpina1cQ00896 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Serpina1cQ00896 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Serpina1cQ00896 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Serpina1cQ00896 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Serpina1cQ00896 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Serpina1cQ00896 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Serpina1cQ00896 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Serpina1cQ00896 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Serpina1cQ00896 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Serpina1cQ00896 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Serpina1cQ00896 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Serpina1cQ00896 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Serpina1cQ00896 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Serpina1cQ00896 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Serpina1cQ00896 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Serpina1cQ00896 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Serpina1cQ00896 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms