Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SeleQ00690 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SeleQ00690 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SeleQ00690 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeleQ00690 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SeleQ00690 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SeleQ00690 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SeleQ00690 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SeleQ00690 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SeleQ00690 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SeleQ00690 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SeleQ00690 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SeleQ00690 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SeleQ00690 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SeleQ00690 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SeleQ00690 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SeleQ00690 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SeleQ00690 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SeleQ00690 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms