Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
AlkP97793 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
AlkP97793 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
AlkP97793 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
AlkP97793 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
AlkP97793 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
AlkP97793 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
AlkP97793 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
AlkP97793 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
AlkP97793 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
AlkP97793 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
AlkP97793 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
AlkP97793 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
AlkP97793 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
AlkP97793 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
AlkP97793 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
AlkP97793 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.61■■■■□ 3.29
AlkP97793 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
AlkP97793 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
AlkP97793 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
AlkP97793 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
AlkP97793 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
AlkP97793 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
AlkP97793 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
AlkP97793 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
AlkP97793 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
AlkP97793 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
AlkP97793 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
AlkP97793 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
AlkP97793 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
AlkP97793 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
AlkP97793 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
AlkP97793 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
AlkP97793 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
AlkP97793 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
AlkP97793 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
AlkP97793 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
AlkP97793 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
AlkP97793 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
AlkP97793 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
AlkP97793 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
AlkP97793 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
AlkP97793 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
AlkP97793 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
AlkP97793 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
AlkP97793 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
AlkP97793 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
AlkP97793 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
AlkP97793 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
AlkP97793 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
AlkP97793 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
AlkP97793 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
AlkP97793 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
AlkP97793 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
AlkP97793 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
AlkP97793 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
AlkP97793 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
AlkP97793 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
AlkP97793 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
AlkP97793 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
AlkP97793 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
AlkP97793 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
AlkP97793 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
AlkP97793 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
AlkP97793 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
AlkP97793 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
AlkP97793 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
AlkP97793 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
AlkP97793 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
AlkP97793 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
AlkP97793 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
AlkP97793 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
AlkP97793 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
AlkP97793 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
AlkP97793 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
AlkP97793 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
AlkP97793 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
AlkP97793 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
AlkP97793 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
AlkP97793 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
AlkP97793 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
AlkP97793 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
AlkP97793 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
AlkP97793 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
AlkP97793 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
AlkP97793 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
AlkP97793 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
AlkP97793 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
AlkP97793 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
AlkP97793 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
AlkP97793 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
AlkP97793 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
AlkP97793 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
AlkP97793 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
AlkP97793 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
AlkP97793 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
AlkP97793 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
AlkP97793 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
AlkP97793 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
AlkP97793 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms