Protein–RNA interactions for Protein: P97760

Polr2c, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2cP97760 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Polr2cP97760 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Polr2cP97760 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr2cP97760 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2cP97760 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2cP97760 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Polr2cP97760 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Polr2cP97760 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms