Protein–RNA interactions for Protein: P97494

Gclc, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclcP97494 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GclcP97494 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GclcP97494 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GclcP97494 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GclcP97494 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GclcP97494 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GclcP97494 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GclcP97494 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GclcP97494 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GclcP97494 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GclcP97494 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GclcP97494 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GclcP97494 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GclcP97494 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GclcP97494 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GclcP97494 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GclcP97494 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GclcP97494 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GclcP97494 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GclcP97494 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GclcP97494 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GclcP97494 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GclcP97494 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GclcP97494 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GclcP97494 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GclcP97494 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GclcP97494 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GclcP97494 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GclcP97494 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GclcP97494 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GclcP97494 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GclcP97494 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GclcP97494 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GclcP97494 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GclcP97494 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GclcP97494 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GclcP97494 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GclcP97494 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GclcP97494 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GclcP97494 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GclcP97494 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GclcP97494 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GclcP97494 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GclcP97494 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GclcP97494 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GclcP97494 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GclcP97494 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GclcP97494 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GclcP97494 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GclcP97494 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GclcP97494 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GclcP97494 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GclcP97494 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GclcP97494 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GclcP97494 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GclcP97494 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GclcP97494 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GclcP97494 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GclcP97494 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GclcP97494 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GclcP97494 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GclcP97494 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GclcP97494 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GclcP97494 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GclcP97494 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GclcP97494 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GclcP97494 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GclcP97494 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GclcP97494 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GclcP97494 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GclcP97494 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GclcP97494 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GclcP97494 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GclcP97494 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GclcP97494 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GclcP97494 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GclcP97494 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GclcP97494 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GclcP97494 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GclcP97494 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GclcP97494 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GclcP97494 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GclcP97494 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GclcP97494 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GclcP97494 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GclcP97494 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GclcP97494 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GclcP97494 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GclcP97494 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GclcP97494 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GclcP97494 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GclcP97494 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GclcP97494 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GclcP97494 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GclcP97494 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GclcP97494 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GclcP97494 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GclcP97494 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GclcP97494 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GclcP97494 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms