Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lig3P97386 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lig3P97386 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lig3P97386 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lig3P97386 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lig3P97386 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lig3P97386 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lig3P97386 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lig3P97386 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lig3P97386 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lig3P97386 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lig3P97386 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lig3P97386 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig3P97386 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lig3P97386 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lig3P97386 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig3P97386 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lig3P97386 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms