Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HpcaP84075 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HpcaP84075 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HpcaP84075 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HpcaP84075 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HpcaP84075 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpcaP84075 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HpcaP84075 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HpcaP84075 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HpcaP84075 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HpcaP84075 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HpcaP84075 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HpcaP84075 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HpcaP84075 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HpcaP84075 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HpcaP84075 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HpcaP84075 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HpcaP84075 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms