Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgcdP82347 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SgcdP82347 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgcdP82347 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgcdP82347 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SgcdP82347 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgcdP82347 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SgcdP82347 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SgcdP82347 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgcdP82347 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgcdP82347 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SgcdP82347 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgcdP82347 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgcdP82347 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SgcdP82347 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SgcdP82347 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SgcdP82347 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms