Protein–RNA interactions for Protein: P70441

Slc9a3r1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r1P70441 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc9a3r1P70441 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc9a3r1P70441 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc9a3r1P70441 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc9a3r1P70441 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc9a3r1P70441 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc9a3r1P70441 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc9a3r1P70441 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms