Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdh9P70407 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh9P70407 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh9P70407 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh9P70407 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh9P70407 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh9P70407 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh9P70407 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdh9P70407 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdh9P70407 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh9P70407 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh9P70407 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh9P70407 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdh9P70407 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdh9P70407 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh9P70407 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh9P70407 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cdh9P70407 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms