Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tgif1P70284 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tgif1P70284 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tgif1P70284 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgif1P70284 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgif1P70284 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tgif1P70284 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms