Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tuba1cP68373 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tuba1cP68373 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tuba1cP68373 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tuba1cP68373 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tuba1cP68373 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tuba1cP68373 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms