Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpl18aP62717 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl18aP62717 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl18aP62717 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rpl18aP62717 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rpl18aP62717 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms