Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snrpd1P62315 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpd1P62315 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snrpd1P62315 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Snrpd1P62315 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Snrpd1P62315 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snrpd1P62315 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms