Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps29P62274 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps29P62274 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps29P62274 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps29P62274 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rps29P62274 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps29P62274 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rps29P62274 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps29P62274 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps29P62274 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rps29P62274 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rps29P62274 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps29P62274 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps29P62274 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rps29P62274 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rps29P62274 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rps29P62274 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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