Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab8bP61028 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab8bP61028 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab8bP61028 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab8bP61028 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab8bP61028 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab8bP61028 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab8bP61028 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab8bP61028 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab8bP61028 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab8bP61028 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab8bP61028 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rab8bP61028 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab8bP61028 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab8bP61028 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms