Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sem1P60897 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sem1P60897 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sem1P60897 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sem1P60897 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sem1P60897 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sem1P60897 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sem1P60897 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sem1P60897 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sem1P60897 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sem1P60897 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sem1P60897 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sem1P60897 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms