Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Uchl4P58321 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Uchl4P58321 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uchl4P58321 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Uchl4P58321 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Uchl4P58321 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uchl4P58321 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Uchl4P58321 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uchl4P58321 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uchl4P58321 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uchl4P58321 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Uchl4P58321 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uchl4P58321 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uchl4P58321 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms