Protein–RNA interactions for Protein: P57774

Npy, Pro-neuropeptide Y, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpyP57774 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NpyP57774 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NpyP57774 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NpyP57774 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NpyP57774 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NpyP57774 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NpyP57774 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NpyP57774 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NpyP57774 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NpyP57774 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NpyP57774 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NpyP57774 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NpyP57774 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NpyP57774 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NpyP57774 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NpyP57774 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NpyP57774 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NpyP57774 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NpyP57774 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NpyP57774 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NpyP57774 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NpyP57774 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NpyP57774 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NpyP57774 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NpyP57774 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NpyP57774 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NpyP57774 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NpyP57774 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NpyP57774 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NpyP57774 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NpyP57774 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NpyP57774 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NpyP57774 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NpyP57774 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NpyP57774 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NpyP57774 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NpyP57774 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NpyP57774 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NpyP57774 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NpyP57774 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NpyP57774 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NpyP57774 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NpyP57774 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NpyP57774 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NpyP57774 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NpyP57774 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NpyP57774 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NpyP57774 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NpyP57774 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NpyP57774 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NpyP57774 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NpyP57774 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NpyP57774 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NpyP57774 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NpyP57774 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NpyP57774 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NpyP57774 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NpyP57774 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NpyP57774 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NpyP57774 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NpyP57774 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NpyP57774 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NpyP57774 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NpyP57774 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NpyP57774 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NpyP57774 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NpyP57774 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NpyP57774 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NpyP57774 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NpyP57774 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NpyP57774 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NpyP57774 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NpyP57774 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NpyP57774 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NpyP57774 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NpyP57774 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NpyP57774 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NpyP57774 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NpyP57774 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms