Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh5P55284 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh5P55284 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh5P55284 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdh5P55284 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdh5P55284 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh5P55284 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms