Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cux1P53564 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cux1P53564 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cux1P53564 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cux1P53564 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
Cux1P53564 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Cux1P53564 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cux1P53564 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Cux1P53564 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Cux1P53564 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Cux1P53564 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cux1P53564 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Cux1P53564 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cux1P53564 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Cux1P53564 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cux1P53564 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cux1P53564 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cux1P53564 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
Cux1P53564 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Cux1P53564 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cux1P53564 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cux1P53564 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cux1P53564 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cux1P53564 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cux1P53564 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cux1P53564 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cux1P53564 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Cux1P53564 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cux1P53564 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Cux1P53564 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cux1P53564 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cux1P53564 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cux1P53564 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cux1P53564 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cux1P53564 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cux1P53564 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Cux1P53564 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cux1P53564 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cux1P53564 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cux1P53564 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Cux1P53564 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cux1P53564 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cux1P53564 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cux1P53564 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cux1P53564 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cux1P53564 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cux1P53564 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cux1P53564 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cux1P53564 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cux1P53564 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cux1P53564 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cux1P53564 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cux1P53564 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cux1P53564 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Cux1P53564 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cux1P53564 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cux1P53564 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cux1P53564 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Cux1P53564 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cux1P53564 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cux1P53564 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cux1P53564 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cux1P53564 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cux1P53564 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Cux1P53564 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Cux1P53564 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cux1P53564 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cux1P53564 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cux1P53564 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cux1P53564 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cux1P53564 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Cux1P53564 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cux1P53564 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cux1P53564 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
Cux1P53564 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cux1P53564 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cux1P53564 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cux1P53564 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cux1P53564 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cux1P53564 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Cux1P53564 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms