Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndst2P52850 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ndst2P52850 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndst2P52850 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndst2P52850 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndst2P52850 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ndst2P52850 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndst2P52850 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ndst2P52850 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndst2P52850 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms