Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec1P51908 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Apobec1P51908 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apobec1P51908 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Apobec1P51908 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apobec1P51908 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Apobec1P51908 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec1P51908 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec1P51908 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec1P51908 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec1P51908 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec1P51908 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apobec1P51908 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apobec1P51908 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apobec1P51908 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec1P51908 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apobec1P51908 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apobec1P51908 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apobec1P51908 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms