Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptx3P48759 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptx3P48759 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ptx3P48759 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptx3P48759 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ptx3P48759 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptx3P48759 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ptx3P48759 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ptx3P48759 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ptx3P48759 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptx3P48759 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ptx3P48759 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ptx3P48759 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptx3P48759 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms