Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tnfrsf4P47741 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfrsf4P47741 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfrsf4P47741 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfrsf4P47741 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tnfrsf4P47741 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tnfrsf4P47741 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms