Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sipa1P46062 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sipa1P46062 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sipa1P46062 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sipa1P46062 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sipa1P46062 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.5 ms