Protein–RNA interactions for Protein: P43137

Reg1, Lithostathine-1, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg1P43137 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reg1P43137 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reg1P43137 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reg1P43137 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Reg1P43137 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Reg1P43137 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Reg1P43137 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reg1P43137 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reg1P43137 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reg1P43137 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Reg1P43137 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reg1P43137 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reg1P43137 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reg1P43137 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Reg1P43137 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reg1P43137 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reg1P43137 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reg1P43137 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Reg1P43137 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reg1P43137 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Reg1P43137 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms