Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nkx1-2P42580 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nkx1-2P42580 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nkx1-2P42580 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nkx1-2P42580 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nkx1-2P42580 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nkx1-2P42580 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nkx1-2P42580 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nkx1-2P42580 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nkx1-2P42580 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Nkx1-2P42580 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nkx1-2P42580 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nkx1-2P42580 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Nkx1-2P42580 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Nkx1-2P42580 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nkx1-2P42580 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms