Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm5cP41230 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm5cP41230 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm5cP41230 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Kdm5cP41230 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Kdm5cP41230 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm5cP41230 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Kdm5cP41230 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kdm5cP41230 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kdm5cP41230 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kdm5cP41230 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kdm5cP41230 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Kdm5cP41230 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Kdm5cP41230 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Kdm5cP41230 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Kdm5cP41230 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5cP41230 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5cP41230 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5cP41230 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Kdm5cP41230 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm5cP41230 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm5cP41230 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm5cP41230 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm5cP41230 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm5cP41230 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Kdm5cP41230 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Kdm5cP41230 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5cP41230 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm5cP41230 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Kdm5cP41230 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5cP41230 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5cP41230 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Kdm5cP41230 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Kdm5cP41230 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm5cP41230 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Kdm5cP41230 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm5cP41230 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms