Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syt4P40749 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syt4P40749 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syt4P40749 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syt4P40749 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Syt4P40749 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt4P40749 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Syt4P40749 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt4P40749 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt4P40749 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt4P40749 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt4P40749 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Syt4P40749 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syt4P40749 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syt4P40749 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Syt4P40749 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syt4P40749 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syt4P40749 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syt4P40749 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syt4P40749 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms