Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
PtprkP35822 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
PtprkP35822 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PtprkP35822 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PtprkP35822 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PtprkP35822 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PtprkP35822 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PtprkP35822 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
PtprkP35822 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
PtprkP35822 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PtprkP35822 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
PtprkP35822 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC39.53■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
PtprkP35822 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PtprkP35822 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
PtprkP35822 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PtprkP35822 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PtprkP35822 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PtprkP35822 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PtprkP35822 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PtprkP35822 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PtprkP35822 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PtprkP35822 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PtprkP35822 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
PtprkP35822 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
PtprkP35822 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
PtprkP35822 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC39.36■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
PtprkP35822 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
PtprkP35822 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
PtprkP35822 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
PtprkP35822 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
PtprkP35822 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
PtprkP35822 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PtprkP35822 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
PtprkP35822 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PtprkP35822 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
PtprkP35822 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
PtprkP35822 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprkP35822 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PtprkP35822 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
PtprkP35822 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC39.13■■■■□ 3.85
PtprkP35822 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PtprkP35822 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
PtprkP35822 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
PtprkP35822 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
PtprkP35822 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
PtprkP35822 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms