Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc5P35689 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ercc5P35689 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ercc5P35689 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ercc5P35689 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ercc5P35689 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ercc5P35689 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms