Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TpoP35419 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TpoP35419 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TpoP35419 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TpoP35419 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpoP35419 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpoP35419 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpoP35419 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpoP35419 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpoP35419 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TpoP35419 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TpoP35419 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TpoP35419 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TpoP35419 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TpoP35419 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TpoP35419 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TpoP35419 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TpoP35419 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TpoP35419 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TpoP35419 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TpoP35419 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TpoP35419 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TpoP35419 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TpoP35419 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TpoP35419 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TpoP35419 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TpoP35419 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TpoP35419 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TpoP35419 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TpoP35419 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TpoP35419 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TpoP35419 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TpoP35419 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TpoP35419 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TpoP35419 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TpoP35419 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TpoP35419 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TpoP35419 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TpoP35419 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TpoP35419 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TpoP35419 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TpoP35419 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TpoP35419 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TpoP35419 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TpoP35419 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TpoP35419 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TpoP35419 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TpoP35419 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TpoP35419 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TpoP35419 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TpoP35419 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TpoP35419 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TpoP35419 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TpoP35419 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TpoP35419 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TpoP35419 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TpoP35419 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TpoP35419 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TpoP35419 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TpoP35419 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TpoP35419 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TpoP35419 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TpoP35419 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TpoP35419 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TpoP35419 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TpoP35419 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TpoP35419 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TpoP35419 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TpoP35419 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TpoP35419 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TpoP35419 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TpoP35419 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TpoP35419 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TpoP35419 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TpoP35419 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TpoP35419 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TpoP35419 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TpoP35419 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TpoP35419 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TpoP35419 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TpoP35419 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TpoP35419 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TpoP35419 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TpoP35419 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TpoP35419 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TpoP35419 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TpoP35419 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TpoP35419 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TpoP35419 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TpoP35419 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TpoP35419 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TpoP35419 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TpoP35419 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TpoP35419 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TpoP35419 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TpoP35419 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TpoP35419 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TpoP35419 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TpoP35419 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TpoP35419 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms