Protein–RNA interactions for Protein: P33434

Mmp2, 72 kDa type IV collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp2P33434 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mmp2P33434 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp2P33434 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp2P33434 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mmp2P33434 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mmp2P33434 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp2P33434 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mmp2P33434 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp2P33434 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp2P33434 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp2P33434 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp2P33434 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp2P33434 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp2P33434 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp2P33434 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms