Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctnnd1P30999 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctnnd1P30999 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnnd1P30999 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnnd1P30999 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctnnd1P30999 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnd1P30999 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnnd1P30999 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnnd1P30999 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnnd1P30999 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnnd1P30999 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnd1P30999 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnd1P30999 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnnd1P30999 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnnd1P30999 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnd1P30999 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms