Protein–RNA interactions for Protein: P29478

SEC65, Signal recognition particle subunit SEC65, yeastyeast

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC65P29478 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 YMC2YBR104W 990 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 YLR072WYLR072W 2082 nt9.06□□□□□ -0.96
SEC65P29478 PTC6YCR079W 1329 nt9.05□□□□□ -0.96
SEC65P29478 ESS1YJR017C 513 nt9.05□□□□□ -0.96
SEC65P29478 FSH2YMR222C 672 nt9.05□□□□□ -0.96
SEC65P29478 PGC1YPL206C 966 nt9.05□□□□□ -0.96
SEC65P29478 NPP1YCR026C 2229 nt9.05□□□□□ -0.96
SEC65P29478 ALD5YER073W 1563 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC65P29478 PAU5YFL020C 369 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC65P29478 PAU15YIR041W 375 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC65P29478 AAC3YBR085W 924 nt9.04□□□□□ -0.96
SEC65P29478 KRE1YNL322C 942 nt9.03□□□□□ -0.96
SEC65P29478 YGR139WYGR139W 339 nt9.02□□□□□ -0.97
SEC65P29478 SRM1YGL097W 1449 nt9.02□□□□□ -0.97
SEC65P29478 HXK1YFR053C 1458 nt9.02□□□□□ -0.97
SEC65P29478 PHB2YGR231C 933 nt9.01□□□□□ -0.97
SEC65P29478 EMC3YKL207W 762 nt9.01□□□□□ -0.97
SEC65P29478 YKR012CYKR012C 378 nt9.01□□□□□ -0.97
SEC65P29478 SDS24YBR214W 1584 nt9.01□□□□□ -0.97
SEC65P29478 MRS4YKR052C 915 nt9□□□□□ -0.97
SEC65P29478 YOR072WYOR072W 315 nt9□□□□□ -0.97
SEC65P29478 BSP1YPR171W 1731 nt9□□□□□ -0.97
SEC65P29478 VBA3YCL069W 1377 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC65P29478 IGD1YFR017C 588 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC65P29478 ADH3YMR083W 1128 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC65P29478 YPT11YNL304W 1254 nt8.99□□□□□ -0.97
SEC65P29478 TPN1YGL186C 1740 nt8.98□□□□□ -0.97
SEC65P29478 MIM1YOL026C 342 nt8.98□□□□□ -0.97
SEC65P29478 HBS1YKR084C 1836 nt8.97□□□□□ -0.97
SEC65P29478 snR86snR86 1004 nt8.97□□□□□ -0.97
SEC65P29478 STP3YLR375W 1032 nt8.97□□□□□ -0.97
SEC65P29478 DUR3YHL016C 2208 nt8.95□□□□□ -0.98
SEC65P29478 YBR232CYBR232C 360 nt8.95□□□□□ -0.98
SEC65P29478 TMS1YDR105C 1422 nt8.95□□□□□ -0.98
SEC65P29478 PAR32YDL173W 888 nt8.93□□□□□ -0.98
SEC65P29478 MEX67YPL169C 1800 nt8.92□□□□□ -0.98
SEC65P29478 YMR210WYMR210W 1350 nt8.91□□□□□ -0.98
SEC65P29478 FTH1YBR207W 1398 nt8.91□□□□□ -0.98
SEC65P29478 ABP1YCR088W 1779 nt8.91□□□□□ -0.98
SEC65P29478 YFR020WYFR020W 699 nt8.9□□□□□ -0.98
SEC65P29478 YBR056WYBR056W 1506 nt8.9□□□□□ -0.99
SEC65P29478 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.89□□□□□ -0.99
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SEC65P29478 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 LEA1YPL213W 717 nt8.89□□□□□ -0.99
SEC65P29478 LYS20YDL182W 1287 nt8.88□□□□□ -0.99
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SEC65P29478 ORT1YOR130C 879 nt8.88□□□□□ -0.99
SEC65P29478 MOB1YIL106W 945 nt8.87□□□□□ -0.99
SEC65P29478 FLX1YIL134W 936 nt8.87□□□□□ -0.99
SEC65P29478 MEP1YGR121C 1479 nt8.86□□□□□ -0.99
SEC65P29478 URA8YJR103W 1737 nt8.85□□□□□ -0.99
SEC65P29478 ENO1YGR254W 1314 nt8.85□□□□□ -0.99
SEC65P29478 YJL009WYJL009W 327 nt8.84□□□□□ -0.99
SEC65P29478 RSM7YJR113C 744 nt8.84□□□□□ -0.99
SEC65P29478 IPL1YPL209C 1104 nt8.84□□□□□ -0.99
SEC65P29478 YJR149WYJR149W 1215 nt8.83□□□□□ -1
SEC65P29478 HIS3YOR202W 663 nt8.83□□□□□ -1
SEC65P29478 PAB1YER165W 1734 nt8.82□□□□□ -1
SEC65P29478 YIR035CYIR035C 765 nt8.81□□□□□ -1
SEC65P29478 snR4snR4 186 nt8.81□□□□□ -1
SEC65P29478 MAS1YLR163C 1389 nt8.81□□□□□ -1
SEC65P29478 RNA170RNA170 169 nt8.8□□□□□ -1
SEC65P29478 BUB2YMR055C 921 nt8.8□□□□□ -1
SEC65P29478 RSC4YKR008W 1878 nt8.79□□□□□ -1
SEC65P29478 DUS3YLR401C 2007 nt8.78□□□□□ -1
SEC65P29478 YLR280CYLR280C 351 nt8.77□□□□□ -1.01
SEC65P29478 MDL2YPL270W 2322 nt8.77□□□□□ -1.01
SEC65P29478 SRP102YKL154W 735 nt8.76□□□□□ -1.01
SEC65P29478 CSM2YIL132C 642 nt8.75□□□□□ -1.01
SEC65P29478 CYC3YAL039C 810 nt8.75□□□□□ -1.01
SEC65P29478 MET22YOL064C 1074 nt8.75□□□□□ -1.01
SEC65P29478 ERO1YML130C 1692 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC65P29478 LRO1YNR008W 1986 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC65P29478 MRN1YPL184C 1839 nt8.73□□□□□ -1.01
SEC65P29478 BUD31YCR063W 474 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC65P29478 YJL064WYJL064W 396 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC65P29478 DIP5YPL265W 1827 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC65P29478 DIA4YHR011W 1341 nt8.72□□□□□ -1.01
SEC65P29478 EHT1YBR177C 1356 nt8.72□□□□□ -1.01
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