Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dusp1P28563 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dusp1P28563 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Dusp1P28563 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dusp1P28563 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dusp1P28563 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms