Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb9P28076 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb9P28076 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb9P28076 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb9P28076 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmb9P28076 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb9P28076 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb9P28076 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb9P28076 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmb9P28076 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Psmb9P28076 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmb9P28076 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psmb9P28076 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms