Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BrafP28028 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BrafP28028 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BrafP28028 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BrafP28028 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
BrafP28028 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrafP28028 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrafP28028 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrafP28028 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BrafP28028 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BrafP28028 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrafP28028 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrafP28028 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrafP28028 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrafP28028 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BrafP28028 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrafP28028 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrafP28028 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrafP28028 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BrafP28028 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrafP28028 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrafP28028 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrafP28028 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BrafP28028 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrafP28028 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrafP28028 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrafP28028 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BrafP28028 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrafP28028 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BrafP28028 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrafP28028 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrafP28028 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BrafP28028 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrafP28028 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrafP28028 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BrafP28028 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrafP28028 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BrafP28028 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrafP28028 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrafP28028 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrafP28028 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BrafP28028 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BrafP28028 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrafP28028 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrafP28028 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BrafP28028 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrafP28028 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrafP28028 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrafP28028 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BrafP28028 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BrafP28028 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BrafP28028 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BrafP28028 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BrafP28028 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BrafP28028 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BrafP28028 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BrafP28028 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BrafP28028 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BrafP28028 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BrafP28028 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BrafP28028 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrafP28028 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BrafP28028 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BrafP28028 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BrafP28028 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BrafP28028 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrafP28028 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrafP28028 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrafP28028 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BrafP28028 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrafP28028 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrafP28028 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BrafP28028 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrafP28028 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrafP28028 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BrafP28028 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BrafP28028 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BrafP28028 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BrafP28028 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BrafP28028 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrafP28028 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrafP28028 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrafP28028 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrafP28028 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrafP28028 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BrafP28028 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrafP28028 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrafP28028 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrafP28028 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BrafP28028 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BrafP28028 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BrafP28028 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BrafP28028 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BrafP28028 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrafP28028 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrafP28028 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BrafP28028 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrafP28028 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrafP28028 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BrafP28028 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.9 ms