Protein–RNA interactions for Protein: P26516

Psmd7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd7P26516 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psmd7P26516 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Psmd7P26516 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmd7P26516 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmd7P26516 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmd7P26516 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms