Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CftrP26361 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CftrP26361 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
CftrP26361 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CftrP26361 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.39
CftrP26361 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
CftrP26361 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CftrP26361 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CftrP26361 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CftrP26361 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
CftrP26361 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CftrP26361 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
CftrP26361 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
CftrP26361 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
CftrP26361 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CftrP26361 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CftrP26361 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
CftrP26361 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC42.37■■■■■ 4.37
CftrP26361 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CftrP26361 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
CftrP26361 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CftrP26361 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
CftrP26361 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
CftrP26361 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CftrP26361 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CftrP26361 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CftrP26361 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
CftrP26361 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
CftrP26361 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CftrP26361 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
CftrP26361 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CftrP26361 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CftrP26361 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CftrP26361 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CftrP26361 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
CftrP26361 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CftrP26361 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
CftrP26361 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CftrP26361 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
CftrP26361 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CftrP26361 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
CftrP26361 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CftrP26361 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CftrP26361 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
CftrP26361 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CftrP26361 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
CftrP26361 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
CftrP26361 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
CftrP26361 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CftrP26361 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CftrP26361 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
CftrP26361 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
CftrP26361 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CftrP26361 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CftrP26361 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CftrP26361 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
CftrP26361 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CftrP26361 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CftrP26361 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CftrP26361 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
CftrP26361 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
CftrP26361 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
CftrP26361 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
CftrP26361 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CftrP26361 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
CftrP26361 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
CftrP26361 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CftrP26361 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
CftrP26361 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
CftrP26361 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
CftrP26361 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CftrP26361 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CftrP26361 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CftrP26361 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CftrP26361 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CftrP26361 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
CftrP26361 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
CftrP26361 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
CftrP26361 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CftrP26361 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
CftrP26361 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
CftrP26361 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
CftrP26361 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
CftrP26361 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
CftrP26361 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
CftrP26361 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC42■■■■■ 4.31
CftrP26361 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CftrP26361 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
CftrP26361 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
CftrP26361 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
CftrP26361 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
CftrP26361 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CftrP26361 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
CftrP26361 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CftrP26361 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
CftrP26361 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
CftrP26361 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CftrP26361 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CftrP26361 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CftrP26361 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms