Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmo2P25801 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmo2P25801 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmo2P25801 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmo2P25801 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lmo2P25801 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lmo2P25801 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmo2P25801 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmo2P25801 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmo2P25801 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmo2P25801 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmo2P25801 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmo2P25801 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmo2P25801 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lmo2P25801 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmo2P25801 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmo2P25801 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmo2P25801 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmo2P25801 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmo2P25801 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmo2P25801 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms