Protein–RNA interactions for Protein: P23506

Pcmt1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmt1P23506 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcmt1P23506 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcmt1P23506 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcmt1P23506 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcmt1P23506 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcmt1P23506 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmt1P23506 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmt1P23506 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmt1P23506 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmt1P23506 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcmt1P23506 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmt1P23506 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcmt1P23506 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms