Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrkchP23298 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrkchP23298 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrkchP23298 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrkchP23298 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkchP23298 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrkchP23298 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkchP23298 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PrkchP23298 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkchP23298 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PrkchP23298 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PrkchP23298 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkchP23298 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PrkchP23298 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PrkchP23298 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkchP23298 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PrkchP23298 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkchP23298 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PrkchP23298 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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