Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rps6ka3P18654 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps6ka3P18654 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rps6ka3P18654 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6ka3P18654 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6ka3P18654 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms