Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SellP18337 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SellP18337 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SellP18337 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SellP18337 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SellP18337 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SellP18337 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SellP18337 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SellP18337 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SellP18337 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SellP18337 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SellP18337 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SellP18337 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SellP18337 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SellP18337 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SellP18337 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SellP18337 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SellP18337 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SellP18337 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SellP18337 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SellP18337 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SellP18337 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SellP18337 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SellP18337 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SellP18337 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SellP18337 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SellP18337 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SellP18337 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SellP18337 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SellP18337 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SellP18337 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SellP18337 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SellP18337 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SellP18337 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SellP18337 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SellP18337 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SellP18337 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SellP18337 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SellP18337 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SellP18337 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SellP18337 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SellP18337 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SellP18337 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SellP18337 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SellP18337 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SellP18337 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SellP18337 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SellP18337 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SellP18337 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SellP18337 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SellP18337 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SellP18337 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SellP18337 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SellP18337 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SellP18337 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SellP18337 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SellP18337 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SellP18337 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SellP18337 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SellP18337 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SellP18337 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SellP18337 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SellP18337 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SellP18337 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SellP18337 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SellP18337 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SellP18337 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SellP18337 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SellP18337 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SellP18337 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SellP18337 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SellP18337 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SellP18337 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SellP18337 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SellP18337 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SellP18337 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SellP18337 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SellP18337 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SellP18337 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SellP18337 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SellP18337 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SellP18337 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SellP18337 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SellP18337 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SellP18337 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SellP18337 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SellP18337 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SellP18337 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SellP18337 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SellP18337 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SellP18337 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SellP18337 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SellP18337 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SellP18337 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SellP18337 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SellP18337 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SellP18337 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SellP18337 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SellP18337 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SellP18337 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.8 ms