Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb2P13373 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vpreb2P13373 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb2P13373 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms