Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg5P12961 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg5P12961 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg5P12961 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Scg5P12961 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg5P12961 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Scg5P12961 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg5P12961 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Scg5P12961 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scg5P12961 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Scg5P12961 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg5P12961 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Scg5P12961 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg5P12961 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scg5P12961 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scg5P12961 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg5P12961 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scg5P12961 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg5P12961 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scg5P12961 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg5P12961 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg5P12961 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg5P12961 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scg5P12961 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scg5P12961 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scg5P12961 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scg5P12961 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg5P12961 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scg5P12961 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms