Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cd1d1P11609 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cd1d1P11609 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd1d1P11609 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd1d1P11609 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cd1d1P11609 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms