Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PolP10400 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PolP10400 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PolP10400 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PolP10400 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PolP10400 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PolP10400 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PolP10400 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP10400 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP10400 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP10400 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PolP10400 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP10400 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP10400 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP10400 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PolP10400 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP10400 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PolP10400 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP10400 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP10400 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PolP10400 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP10400 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP10400 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP10400 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP10400 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PolP10400 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP10400 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP10400 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP10400 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP10400 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PolP10400 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP10400 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP10400 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP10400 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP10400 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP10400 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PolP10400 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PolP10400 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP10400 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP10400 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP10400 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP10400 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP10400 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PolP10400 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP10400 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP10400 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PolP10400 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP10400 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP10400 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PolP10400 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PolP10400 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PolP10400 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PolP10400 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PolP10400 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PolP10400 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PolP10400 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PolP10400 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PolP10400 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PolP10400 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PolP10400 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PolP10400 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PolP10400 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PolP10400 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PolP10400 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PolP10400 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PolP10400 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PolP10400 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PolP10400 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PolP10400 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PolP10400 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PolP10400 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PolP10400 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PolP10400 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PolP10400 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PolP10400 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PolP10400 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PolP10400 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PolP10400 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PolP10400 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PolP10400 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PolP10400 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PolP10400 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PolP10400 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PolP10400 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PolP10400 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PolP10400 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PolP10400 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PolP10400 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PolP10400 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PolP10400 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PolP10400 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PolP10400 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PolP10400 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PolP10400 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PolP10400 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PolP10400 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PolP10400 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PolP10400 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PolP10400 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PolP10400 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms